Partie Terrestre :

Le principal enjeu de la réserve est sa forêt sèche endémique à ébène des Comores. Ce type de forêt est en voie de disparition, on y retrouve  espèces végétales remarquables. Certaines n'existent qu'à Mayotte, d'autres ont été recensées uniquement sur l'îlot.

Une faune riche et variée est présente sur la réserve (roussettes, lézards, lémuriens, etc.). Le foudi des Comores, oiseau emblématique en déclin à Mayotte, ainsi que le paille-en-queue y nichent.

Partie marine

La parie marine abrite des écosystèmes sous-marins caractéristiques de cette partie du lagon :

• Grottes et surplombs qui hébergent des espèces de pénombre comme les coraux noirs
• Peuplements coralliens mixtes de coraux durs et de coraux mous
• Éponges barriques et pinacles coralliens exceptionnels

La réserve naturelle est aussi fréquentée par des espèces remarquables comme le dauphin tursiops et la tortue imbriquée

Les menaces

Différentes menaces pèsent sur la réserve naturelle. Sur terre, les feux, les défrichements, le ramassage de fruits et de plantes, la coupe de bois ou le braconnage mettent en péril le suivi de la faune et de la flore exceptionnelles de l'îlot. 

En mer, la pollution, l'envasement, l'ancrage, l'ancrage des bateaux, ainsi que le braconnage, détériorent le récif corallien.